Analiza trajektorii

Czyta klatki ze współrzędnymi atomów i liczy RMSD z nałożeniem metodą kwaternionów, bezpośrednie RMSD, promień bezwładności, fluktuacje na atom, odległości i kąt dwuścienny.

Reads frames of atomic coordinates and computes quaternion-superposed RMSD, direct RMSD, radius of gyration, per-atom fluctuations, distances and a dihedral angle.