Аналіз траєкторії

Читає кадри з координатами атомів і рахує RMSD з накладанням методом кватерніонів, прямий RMSD, радіус інерції, флуктуації на атом, відстані та двогранний кут.

Reads frames of atomic coordinates and computes quaternion-superposed RMSD, direct RMSD, radius of gyration, per-atom fluctuations, distances and a dihedral angle.